learnxinyminutes-docs/fr-fr/r-fr.html.markdown

744 lines
23 KiB
Markdown
Raw Normal View History

2014-12-07 00:47:25 +00:00
---
language: R
contributors:
- ["e99n09", "http://github.com/e99n09"]
- ["isomorphismes", "http://twitter.com/isomorphisms"]
translators:
- ["Anne-Catherine Dehier", "https://github.com/spellart"]
filename: learnr-fr.r
---
R est un langage de programmation statistique. Il dispose de nombreuses
2015-05-04 00:44:23 +00:00
librairies pour le téléchargement et le nettoyage d'ensembles de données,
l'exécution de procédures statistiques, et la réalisation de graphiques.
On peut également exécuter les commmandes `R` au sein d'un document LaTeX.
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```r
# Les commentaires commencent avec des symboles numériques.
# Il n'est pas possible de faire des commentaires multilignes,
# mais on peut superposer plusieurs commentaires comme ceci.
# Sur Windows ou Mac, taper COMMAND-ENTER pour exécuter une ligne
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########################################################################
# Les choses que vous pouvez faire sans rien comprendre
# à la programmation
########################################################################
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# Dans cette section, nous vous montrons quelques trucs cools que vous
# pouvez faire avec R sans rien comprendre à la programmation.
# Ne vous inquiétez pas si vous ne comprenez pas tout ce que le code fait.
# Profitez simplement !
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data() # parcours les ensembles de données préchargées
data(rivers) # récupère ceci : "Lengths of Major North American Rivers"
ls() # notez que "rivers" apparaît maintenant dans votre espace de travail
head(rivers) # donne un aperçu des données
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# 735 320 325 392 524 450
length(rivers) # Combien de rivers ont été mesurées ?
# 141
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summary(rivers) # Quels sont les principales données statistiques ?
# Min. 1st Qu. Median Mean 3rd Qu. Max.
# 135.0 310.0 425.0 591.2 680.0 3710.0
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# Fait un diagramme à tiges et à feuilles (visualisation de données de
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# types histogramme)
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stem(rivers)
# Le point décimal est de 2 chiffres à droite du |
#
# 0 | 4
# 2 | 011223334555566667778888899900001111223333344455555666688888999
# 4 | 111222333445566779001233344567
# 6 | 000112233578012234468
# 8 | 045790018
# 10 | 04507
# 12 | 1471
# 14 | 56
# 16 | 7
# 18 | 9
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# 20 |
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# 22 | 25
# 24 | 3
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# 26 |
# 28 |
# 30 |
# 32 |
# 34 |
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# 36 | 1
2015-05-04 00:44:23 +00:00
stem(log(rivers)) # Notez que les données ne sont ni normales
# ni lognormales !
# Prenez-ça, la courbe en cloche
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# Le point décimal est à 1 chiffre à gauche du |
#
# 48 | 1
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# 50 |
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# 52 | 15578
# 54 | 44571222466689
# 56 | 023334677000124455789
# 58 | 00122366666999933445777
# 60 | 122445567800133459
# 62 | 112666799035
# 64 | 00011334581257889
# 66 | 003683579
# 68 | 0019156
# 70 | 079357
# 72 | 89
# 74 | 84
# 76 | 56
# 78 | 4
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# 80 |
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# 82 | 2
# Fais un histogramme :
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hist(rivers, col="#333333", border="white", breaks=25) # amusez-vous avec ces paramètres
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hist(log(rivers), col="#333333", border="white", breaks=25) # vous ferez plus de tracés plus tard
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# Ici d'autres données qui viennent préchargées. R en a des tonnes.
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data(discoveries)
plot(discoveries, col="#333333", lwd=3, xlab="Year",
main="Number of important discoveries per year")
plot(discoveries, col="#333333", lwd=3, type = "h", xlab="Year",
main="Number of important discoveries per year")
# Plutôt que de laisser l'ordre par défaut (par années)
# Nous pourrions aussi trier pour voir ce qu'il y a de typique
sort(discoveries)
# [1] 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2
# [26] 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 3 3
# [51] 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 4 4 4 4 4 4 4 4
# [76] 4 4 4 4 5 5 5 5 5 5 5 6 6 6 6 6 6 7 7 7 7 8 9 10 12
stem(discoveries, scale=2)
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#
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# Le point décimale est à la |
#
# 0 | 000000000
# 1 | 000000000000
# 2 | 00000000000000000000000000
# 3 | 00000000000000000000
# 4 | 000000000000
# 5 | 0000000
# 6 | 000000
# 7 | 0000
# 8 | 0
# 9 | 0
# 10 | 0
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# 11 |
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# 12 | 0
max(discoveries)
# 12
summary(discoveries)
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# Min. 1st Qu. Median Mean 3rd Qu. Max.
# 0.0 2.0 3.0 3.1 4.0 12.0
2014-12-07 00:47:25 +00:00
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# Lance un dès plusieurs fois
2014-12-07 00:47:25 +00:00
round(runif(7, min=.5, max=6.5))
# 1 4 6 1 4 6 4
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# Vos numéros diffèreront des miens à moins que nous mettions
# le même random.seed(31337)
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# Dessine à partir d'une normale Gaussienne 9 fois
rnorm(9)
# [1] 0.07528471 1.03499859 1.34809556 -0.82356087 0.61638975 -1.88757271
# [7] -0.59975593 0.57629164 1.08455362
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##############################################################
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# les types de données et l'arithmétique de base
2015-05-04 00:44:23 +00:00
##############################################################
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# Maintenant pour la partie orientée programmation du tutoriel.
# Dans cette section vous rencontrerez les types de données importants de R :
# les entiers, les numériques, les caractères, les logiques, et les facteurs.
# LES ENTIERS
# Les entiers de mémoire longue sont écrit avec L
5L # 5
class(5L) # "integer"
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# (Essayez ?class pour plus d'informations sur la fonction class().)
# Avec R, chaque valeur seule, comme 5L, est considéré comme
# un vecteur de longueur 1
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length(5L) # 1
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# On peut avoir un vecteur d'entiers avec une longueur > 1 :
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c(4L, 5L, 8L, 3L) # 4 5 8 3
length(c(4L, 5L, 8L, 3L)) # 4
class(c(4L, 5L, 8L, 3L)) # "integer"
# LES NUMÉRIQUES
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# Un "numeric" est un nombre à virgule flottante d'une précision double
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5 # 5
class(5) # "numeric"
# Encore une fois, tout dans R est un vecteur ;
# Vous pouvez faire un vecteur numérique avec plus d'un élément
c(3,3,3,2,2,1) # 3 3 3 2 2 1
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# Vous pouvez aussi utiliser la notation scientifique
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5e4 # 50000
6.02e23 # nombre d'Avogadro
1.6e-35 # longueur de Planck
# Vous pouvez également avoir des nombres infiniments grands ou petits
class(Inf) # "numeric"
class(-Inf) # "numeric"
# Vous pouvez utiliser "Inf", par exemple, dans integrate(dnorm, 3, Inf);
# Ça permet d'éviter des tableaux Z-scores.
# ARITHMÉTIQUES DE BASE
# Vous pouvez faire de l'arithmétique avec des nombres
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# Faire des opérations arithmétiques en mixant des entiers
# et des numériques
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# donne un autre numérique
10L + 66L # 76 # un entier plus un entier donne un entier
53.2 - 4 # 49.2 # un numérique moins un numérique donne un numérique
2.0 * 2L # 4 # un numérique multiplié par un entier donne un numérique
3L / 4 # 0.75 # un entier sur un numérique donne un numérique
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3 %% 2 # 1 # le reste de deux numériques est un autre numérique
# Les opérations arithmétiques illégales donnent un "Not A Number" :
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0 / 0 # NaN
class(NaN) # "numeric"
# Vous pouvez faire des opérations arithmétiques avec deux vecteurs d'une
# longueur plus grande que 1, à condition que la longueur du plus grand
# vecteur soit un multiple entier du plus petit
c(1,2,3) + c(1,2,3) # 2 4 6
# LES CARACTÈRES
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# Il n'y a pas de différences entre les chaînes de caractères et
# les caractères en R
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"Horatio" # "Horatio"
class("Horatio") # "character"
class('H') # "character"
# Ceux-ci sont tous les deux des vecteurs de longueur 1
# Ici un plus long :
c('alef', 'bet', 'gimmel', 'dalet', 'he')
# =>
# "alef" "bet" "gimmel" "dalet" "he"
length(c("Call","me","Ishmael")) # 3
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# Vous pouvez utiliser des expressions rationnelles sur les vecteurs de caractères :
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substr("Fortuna multis dat nimis, nulli satis.", 9, 15) # "multis "
gsub('u', 'ø', "Fortuna multis dat nimis, nulli satis.") # "Fortøna møltis dat nimis, nølli satis."
# R possède plusieurs vecteurs de caractères préconstruits :
letters
# =>
# [1] "a" "b" "c" "d" "e" "f" "g" "h" "i" "j" "k" "l" "m" "n" "o" "p" "q" "r" "s"
# [20] "t" "u" "v" "w" "x" "y" "z"
month.abb # "Jan" "Feb" "Mar" "Apr" "May" "Jun" "Jul" "Aug" "Sep" "Oct" "Nov" "Dec"
# LES TYPES LOGIQUES
# En R, un "logical" est un booléen
class(TRUE) # "logical"
class(FALSE) # "logical"
# Leur comportement est normal
TRUE == TRUE # TRUE
TRUE == FALSE # FALSE
FALSE != FALSE # FALSE
FALSE != TRUE # TRUE
# Les données manquantes (NA) sont logiques également
class(NA) # "logical"
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# On utilise | et & pour les operations logiques.
# OR
TRUE | FALSE # TRUE
# AND
TRUE & FALSE # FALSE
# Vous pouvez tester si x est TRUE
isTRUE(TRUE) # TRUE
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# Ici nous avons un vecteur de type logique avec plusieurs éléments :
c('Z', 'o', 'r', 'r', 'o') == "Zorro" # FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE
c('Z', 'o', 'r', 'r', 'o') == "Z" # TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE
# LES FACTEURS
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# La classe facteur sert pour les données catégorielles
# les facteurs peuvent être ordonnés (comme les niveaux de
# catégorie d'enfants)
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# ou non ordonnés (comme le sexe)
factor(c("female", "female", "male", NA, "female"))
# female female male <NA> female
# Les niveaux : female male
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# Les "levels" sont les valeurs que les données catégorielles
# peuvent prendre
# Notez que les données manquantes n'entrent pas dans le niveau
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levels(factor(c("male", "male", "female", NA, "female"))) # "female" "male"
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# Si le vecteur de facteurs a une longueur 1, ses niveaux seront
# de longueur 1 également
2014-12-07 00:47:25 +00:00
length(factor("male")) # 1
length(levels(factor("male"))) # 1
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# On rencontre communément des facteurs dans des "data frame",
# un type de données que nous couvrirons plus tard
2014-12-07 00:47:25 +00:00
data(infert) # "Infertility after Spontaneous and Induced Abortion"
levels(infert$education) # "0-5yrs" "6-11yrs" "12+ yrs"
# NULL
# "NULL" est bizarre ; on l'utilise pour effacer un vecteur
class(NULL) # NULL
2015-05-04 00:44:23 +00:00
parakeet = c("beak", "feathers", "wings", "eyes")
2014-12-07 00:47:25 +00:00
parakeet
# =>
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# [1] "beak" "feathers" "wings" "eyes"
2014-12-07 00:47:25 +00:00
parakeet <- NULL
parakeet
# =>
# NULL
# LES CONTRAINTES DE TYPES
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# Les contraintes de types servent à forcer une valeur à prendre
# un type différent
2014-12-07 00:47:25 +00:00
as.character(c(6, 8)) # "6" "8"
as.logical(c(1,0,1,1)) # TRUE FALSE TRUE TRUE
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# Si vous mettez des éléments de différents types dans un vecteur,
# des coercitions bizarres se produisent :
2014-12-07 00:47:25 +00:00
c(TRUE, 4) # 1 4
c("dog", TRUE, 4) # "dog" "TRUE" "4"
as.numeric("Bilbo")
# =>
# [1] NA
# Message d'avertissement :
# NAs est introduit par coercition
# Notez également : ce n'étaient que des types de données basiques
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# Il y a beaucoup d'autres types de données, comme pour les dates,
# les séries temporelles, etc ...
2014-12-07 00:47:25 +00:00
2015-05-04 00:44:23 +00:00
#######################################
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# Variables, boucles , if/else
2015-05-04 00:44:23 +00:00
#######################################
2014-12-07 00:47:25 +00:00
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# Une variable est comme une boîte dans laquelle on garde une valeur
# pour l'utiliser plus tard.
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# Nous appellons ça "assigner" une valeur à une variable.
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# Avoir des variables nous permet d'écrire des boucles, des fonctions, et
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# des instructions conditionnelles (if/else)
# LES VARIABLES
# Beaucoup de façons d'assigner des choses :
x = 5 # c'est possible
y <- "1" # c'est préféré
TRUE -> z # ça marche mais c'est bizarre
# LES BOUCLES
# Il y a les boucles for :
for (i in 1:4) {
print(i)
}
# Il y a les boucles while :
a <- 10
while (a > 4) {
2015-05-04 00:44:23 +00:00
cat(a, "...", sep = "")
a <- a - 1
2014-12-07 00:47:25 +00:00
}
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# Gardez à l'esprit que les boucles for et while s'exécutent lentement
# en R
# Des opérations sur des vecteurs entiers (ex une ligne entière,
# une colonne entière),
# ou les fonctions de type apply() (nous en parlerons plus tard),
# sont préférées
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# IF/ELSE
# Encore une fois assez standard
if (4 > 3) {
2015-05-04 00:44:23 +00:00
print("4 is greater than 3")
2014-12-07 00:47:25 +00:00
} else {
2015-05-04 00:44:23 +00:00
print("4 is not greater than 3")
2014-12-07 00:47:25 +00:00
}
# =>
# [1] "4 is greater than 3"
# LES FONCTIONS
# se définissent comme ceci :
jiggle <- function(x) {
2015-05-04 00:44:23 +00:00
x = x + rnorm(1, sd=.1) #add in a bit of (controlled) noise
return(x)
2014-12-07 00:47:25 +00:00
}
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# Appelées comme n'importe quelles autres fonction R :
2014-12-07 00:47:25 +00:00
jiggle(5) # 5±ε. After set.seed(2716057), jiggle(5)==5.005043
2015-05-04 00:44:23 +00:00
##########################################################################
# Les structures de données : les vecteurs, les matrices,
# les data frame et les tableaux
##########################################################################
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# À UNE DIMENSION
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# Commençons par le tout début, et avec quelque chose que
# vous connaissez déjà : les vecteurs.
2014-12-07 00:47:25 +00:00
vec <- c(8, 9, 10, 11)
vec # 8 9 10 11
# Nous demandons des éléments spécifiques en les mettant entre crochets
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# (Notez que R commence à compter à partir de 1)
2014-12-07 00:47:25 +00:00
vec[1] # 8
letters[18] # "r"
LETTERS[13] # "M"
month.name[9] # "September"
c(6, 8, 7, 5, 3, 0, 9)[3] # 7
# Nous pouvons également rechercher des indices de composants spécifiques,
which(vec %% 2 == 0) # 1 3
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# Récupèrer seulement les premières ou dernières entrées du vecteur,
2014-12-07 00:47:25 +00:00
head(vec, 1) # 8
tail(vec, 2) # 10 11
# ou trouver si un certaine valeur est dans le vecteur
any(vec == 10) # TRUE
# Si un index "dépasse" vous obtiendrez NA :
vec[6] # NA
# Vous pouvez trouver la longueur de votre vecteur avec length()
length(vec) # 4
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# Vous pouvez réaliser des opérations sur des vecteurs entiers ou des
# sous-ensembles de vecteurs
2014-12-07 00:47:25 +00:00
vec * 4 # 16 20 24 28
vec[2:3] * 5 # 25 30
any(vec[2:3] == 8) # FALSE
# Et R a beaucoup de fonctions préconstruites pour résumer les vecteurs
mean(vec) # 9.5
var(vec) # 1.666667
sd(vec) # 1.290994
max(vec) # 11
min(vec) # 8
sum(vec) # 38
# Quelques fonctions préconstruites sympas supplémentaires :
5:15 # 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15
seq(from=0, to=31337, by=1337)
# =>
# [1] 0 1337 2674 4011 5348 6685 8022 9359 10696 12033 13370 14707
# [13] 16044 17381 18718 20055 21392 22729 24066 25403 26740 28077 29414 30751
# À DEUX DIMENSIONS (TOUT DANS UNE CLASSE)
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# Vous pouvez créer une matrice à partir d'entrées du même type comme ceci :
2014-12-07 00:47:25 +00:00
mat <- matrix(nrow = 3, ncol = 2, c(1,2,3,4,5,6))
mat
# =>
# [,1] [,2]
# [1,] 1 4
# [2,] 2 5
# [3,] 3 6
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# Différemment du vecteur, la classe d'une matrice est "matrix",
# peut importe ce qu'elle contient
2014-12-07 00:47:25 +00:00
class(mat) # => "matrix"
# Demander la première ligne
mat[1,] # 1 4
# Réaliser une opération sur la première colonne
3 * mat[,1] # 3 6 9
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# Demander une cellule spécifique
2014-12-07 00:47:25 +00:00
mat[3,2] # 6
# Transposer la matrice entière
t(mat)
# =>
# [,1] [,2] [,3]
# [1,] 1 2 3
# [2,] 4 5 6
# La multiplication de matrices
mat %*% t(mat)
# =>
# [,1] [,2] [,3]
# [1,] 17 22 27
# [2,] 22 29 36
# [3,] 27 36 45
# cbind() colle des vecteurs ensemble en colonne pour faire une matrice
mat2 <- cbind(1:4, c("dog", "cat", "bird", "dog"))
mat2
# =>
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# [,1] [,2]
# [1,] "1" "dog"
# [2,] "2" "cat"
# [3,] "3" "bird"
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# [4,] "4" "dog"
class(mat2) # matrix
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# Encore une fois regardez ce qui se passe !
# Parce que les matrices peuvent contenir des entrées de toutes sortes de
# classes, tout sera converti en classe caractère
2014-12-07 00:47:25 +00:00
c(class(mat2[,1]), class(mat2[,2]))
# rbind() colle des vecteurs ensemble par lignes pour faire une matrice
mat3 <- rbind(c(1,2,4,5), c(6,7,0,4))
mat3
# =>
# [,1] [,2] [,3] [,4]
# [1,] 1 2 4 5
# [2,] 6 7 0 4
# Ah, tout de la même classe. Pas de coercitions. Beaucoup mieux.
# À DEUX DIMENSIONS (DE CLASSES DIFFÉRENTES)
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# Pour des colonnes de différents types, utiliser une data frame
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# Cette structure de données est si utile pour la programmation statistique,
# qu'une version a été ajoutée à Python dans le paquet "pandas".
students <- data.frame(c("Cedric","Fred","George","Cho","Draco","Ginny"),
c(3,2,2,1,0,-1),
c("H", "G", "G", "R", "S", "G"))
names(students) <- c("name", "year", "house") # name the columns
class(students) # "data.frame"
students
# =>
# name year house
# 1 Cedric 3 H
# 2 Fred 2 G
# 3 George 2 G
# 4 Cho 1 R
# 5 Draco 0 S
# 6 Ginny -1 G
class(students$year) # "numeric"
class(students[,3]) # "factor"
# Trouver les dimensions
nrow(students) # 6
ncol(students) # 3
dim(students) # 6 3
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# La fonction data.frame() convertit les vecteurs caractères en vecteurs de
# facteurs par défaut; désactiver cette fonction en règlant
# stringsAsFactors = FALSE quand vous créer la data.frame
2014-12-07 00:47:25 +00:00
?data.frame
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# Il y a plusieurs façons de subdiviser les trames de données
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# toutes subtilement différentes
students$year # 3 2 2 1 0 -1
students[,2] # 3 2 2 1 0 -1
students[,"year"] # 3 2 2 1 0 -1
# Une version augmentée de la structure data.frame est data.table
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# Si vous travaillez avec des données volumineuses ou des panels, ou avez
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# besoin de fusionner quelques ensembles de données, data.table peut être
# un bon choix. Ici un tour éclair :
2015-05-04 00:44:23 +00:00
install.packages("data.table") # télécharge le paquet depuis CRAN
require(data.table) # le charge
2014-12-07 00:47:25 +00:00
students <- as.data.table(students)
2015-05-04 00:44:23 +00:00
students # regardez la différence à l'impression
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# =>
# name year house
# 1: Cedric 3 H
# 2: Fred 2 G
# 3: George 2 G
# 4: Cho 1 R
# 5: Draco 0 S
# 6: Ginny -1 G
2015-05-04 00:44:23 +00:00
students[name=="Ginny"] # obtiens les lignes avec name == "Ginny"
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# =>
# name year house
# 1: Ginny -1 G
2015-05-04 00:44:23 +00:00
students[year==2] # obtiens les lignes avec year == 2
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# =>
# name year house
# 1: Fred 2 G
# 2: George 2 G
# data.table facilite la fusion entre deux ensembles de données
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# Faisons une autre data.table pour fusionner students
2014-12-07 00:47:25 +00:00
founders <- data.table(house=c("G","H","R","S"),
founder=c("Godric","Helga","Rowena","Salazar"))
founders
# =>
# house founder
# 1: G Godric
# 2: H Helga
# 3: R Rowena
# 4: S Salazar
setkey(students, house)
setkey(founders, house)
2015-05-04 00:44:23 +00:00
students <- founders[students] # merge les deux ensembles de données qui matchent "house"
2014-12-07 00:47:25 +00:00
setnames(students, c("house","houseFounderName","studentName","year"))
students[,order(c("name","year","house","houseFounderName")), with=F]
# =>
# studentName year house houseFounderName
# 1: Fred 2 G Godric
# 2: George 2 G Godric
# 3: Ginny -1 G Godric
# 4: Cedric 3 H Helga
# 5: Cho 1 R Rowena
# 6: Draco 0 S Salazar
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# data.table facilite le résumé des tableaux
2014-12-07 00:47:25 +00:00
students[,sum(year),by=house]
# =>
# house V1
# 1: G 3
# 2: H 3
# 3: R 1
# 4: S 0
# Pour supprimer une colonne d'une data.frame ou data.table,
# assignez-lui la valeur NULL
students$houseFounderName <- NULL
students
# =>
# studentName year house
# 1: Fred 2 G
# 2: George 2 G
# 3: Ginny -1 G
# 4: Cedric 3 H
# 5: Cho 1 R
# 6: Draco 0 S
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# Supprimer une ligne en subdivisant
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# En utilisant data.table :
students[studentName != "Draco"]
# =>
# house studentName year
# 1: G Fred 2
# 2: G George 2
# 3: G Ginny -1
# 4: H Cedric 3
# 5: R Cho 1
# En utilisant data.frame :
students <- as.data.frame(students)
students[students$house != "G",]
# =>
# house houseFounderName studentName year
# 4 H Helga Cedric 3
# 5 R Rowena Cho 1
# 6 S Salazar Draco 0
# MULTI-DIMENSIONNELLE (TOUS ÉLÉMENTS D'UN TYPE)
# Les arrays créent des tableaux de n dimensions
# Tous les éléments doivent être du même type
# Vous pouvez faire un tableau à 2 dimensions (une sorte de matrice)
array(c(c(1,2,4,5),c(8,9,3,6)), dim=c(2,4))
# =>
# [,1] [,2] [,3] [,4]
# [1,] 1 4 8 3
# [2,] 2 5 9 6
# Vous pouvez utiliser array pour faire des matrices à 3 dimensions aussi
array(c(c(c(2,300,4),c(8,9,0)),c(c(5,60,0),c(66,7,847))), dim=c(3,2,2))
# =>
# , , 1
#
# [,1] [,2]
# [1,] 2 8
# [2,] 300 9
# [3,] 4 0
#
# , , 2
#
# [,1] [,2]
# [1,] 5 66
# [2,] 60 7
# [3,] 0 847
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# LES LISTES (MULTI-DIMENSIONNELLES, ÉVENTUELLEMMENT DÉCHIRÉES,
# DE DIFFÉRENTS TYPES)
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# Enfin R a des listes (de vecteurs)
list1 <- list(time = 1:40)
list1$price = c(rnorm(40,.5*list1$time,4)) # random
list1
# Vous pouvez obtenir des éléments de la liste comme ceci
2015-05-04 00:44:23 +00:00
list1$time # une façon
list1[["time"]] # une autre façon
list1[[1]] # encore une façon différente
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# =>
# [1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33
# [34] 34 35 36 37 38 39 40
# Vous pouvez subdiviser les éléments d'une liste comme n'importe quel vecteur
list1$price[4]
# Les listes ne sont pas les structures de données les plus efficaces
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# à utiliser avec R;
# À moins d'avoir une très bonne raison, vous devriez utiliser data.frames
# Les listes sont souvent retournées par des fonctions qui effectuent
# des régressions linéaires
2014-12-07 00:47:25 +00:00
2015-05-04 00:44:23 +00:00
##########################################
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# La famille de fonction apply()
2015-05-04 00:44:23 +00:00
##########################################
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# Vous vous rappelez mat ?
mat
# =>
# [,1] [,2]
# [1,] 1 4
# [2,] 2 5
# [3,] 3 6
# Utilisez apply(X, MARGIN, FUN) pour appliquer la fonction FUN à la matrice X
# sur les lignes (MAR = 1) ou les colonnes (MAR = 2)
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# R exécute FUN à chaque lignes (ou colonnes) de X, beaucoup plus rapidement
# que le ferait une boucle for ou while
2014-12-07 00:47:25 +00:00
apply(mat, MAR = 2, jiggle)
# =>
# [,1] [,2]
# [1,] 3 15
# [2,] 7 19
# [3,] 11 23
# D'autres fonctions : ?lapply, ?sapply
2015-05-04 00:44:23 +00:00
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# Ne soyez pas trop intimidé ; tout le monde reconnaît que c'est un peu déroutant
# Le paque plyr vise à remplacer (et améliorer !) la famille *apply().
install.packages("plyr")
require(plyr)
?plyr
2015-05-04 00:44:23 +00:00
############################
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# Charger des données
2015-05-04 00:44:23 +00:00
############################
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# "pets.csv" est un fichier sur internet
# (mais il pourrait être tout aussi facilement sur votre ordinateur)
pets <- read.csv("http://learnxinyminutes.com/docs/pets.csv")
pets
head(pets, 2) # first two rows
tail(pets, 1) # last row
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# Pour sauvegarder une data frame ou une matrice en fichier .csv
2014-12-07 00:47:25 +00:00
write.csv(pets, "pets2.csv") # to make a new .csv file
# définir le répertoire de travail avec setwd(), le récupérer avec getwd()
# Essayez ?read.csv et ?write.csv pour plus d'informations
2015-05-04 00:44:23 +00:00
################
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# Les tracés
2015-05-04 00:44:23 +00:00
################
2014-12-07 00:47:25 +00:00
# LES FONCTIONS DE TRACÉS PRÉCONSTRUITES
# Les diagrammes de dispersion !
plot(list1$time, list1$price, main = "fake data")
# Les régressions !
linearModel <- lm(price ~ time, data = list1)
linearModel # sort le résultat de la régression
# Tracer une ligne de regression sur une tracé existant
abline(linearModel, col = "red")
# Obtenir une variété de diagnostiques sympas
plot(linearModel)
# Les histogrammes !
hist(rpois(n = 10000, lambda = 5), col = "thistle")
# Les diagrammes en bâtons !
barplot(c(1,4,5,1,2), names.arg = c("red","blue","purple","green","yellow"))
# GGPLOT2
# Mais ceux-ci ne sont même pas les plus jolis tracés de R
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# Essayez le paquet ggplot2 pour d'avantages de graphiques
2014-12-07 00:47:25 +00:00
install.packages("ggplot2")
require(ggplot2)
?ggplot2
pp <- ggplot(students, aes(x=house))
pp + geom_histogram()
ll <- as.data.table(list1)
pp <- ggplot(ll, aes(x=time,price))
pp + geom_point()
2015-05-04 00:44:23 +00:00
# ggplot2 a une documentation excellente
#(disponible sur http://docs.ggplot2.org/current/)
2014-12-07 00:47:25 +00:00
```
2015-05-04 00:44:23 +00:00
## Comment j'obtiens R ?
2014-12-07 00:47:25 +00:00
2015-05-04 00:44:23 +00:00
* Obtiens R et R GUI depuis [http://www.r-project.org/](http://www.r-project.org/)
* [RStudio](http://www.rstudio.com/ide/) est un autre GUI